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服務(wù)介紹:
miRNA引物設(shè)計(jì)是針對(duì)成熟序列設(shè)計(jì)的莖環(huán)引物,長(zhǎng)度大約45bp,可以自身成環(huán)。在3’-端序列的反向互補(bǔ)序列引入一段固定的序列形成一個(gè)莖環(huán),即為逆轉(zhuǎn)錄引物;在序列的5’-端引入一段固定的序列,即為擴(kuò)增引物的上游序列。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果展示:
1、引物設(shè)計(jì)
2、引物示例
實(shí)驗(yàn)流程:
設(shè)計(jì)引物-合成引物
使用方法:
miRNA-莖環(huán)法-逆轉(zhuǎn)錄引物(*****-RT)稀釋方法:
1.引物附在離心管內(nèi)壁上,稀釋前請(qǐng)將引物離心數(shù)秒使干粉聚集至管底,小心開啟管蓋,以免引起粉末飛揚(yáng)造成損失;
2.將所有逆轉(zhuǎn)錄引物(-RT,以及U6-A)稀釋成100μM:按照管壁上的nmol數(shù)加入10倍體積的無酶水(Water Nuclease-Free,Servicebio,貨號(hào):G4700);
3.以上稀釋引物各取1μL(-RT,以及U6-A)加入到一個(gè)新的無菌無酶離心管,用無酶水補(bǔ)齊到100ul,混合均勻,即為Gene Specific Primer (1 μM);
逆轉(zhuǎn)錄操作步驟(參考)
以SweScript RT II First Strand cDNA Synthesis Kit (With gDNA Remover)(Servicebio, G3333)為例:
1. 基因組去除:配制基因組去除反應(yīng)體系(推薦10 μL):
10×gDNA Remover Buffer | 1 μL |
gDNA Remover | 1 μL |
Total RNA/mRNA | 0.1 ng-5 μg/10 pg-0.5 μg |
Nuclease-Free Water | Add to 10 μL |
2. 第一鏈cDNA合成
(1) 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系配制(推薦20 μL反應(yīng)體系):
基因組去除反應(yīng)液 | 10 μL |
5×Reaction Buffer | 4 μL |
Gene Specific Primer (1 μM) | 2 μL |
SweScript RT II Enzyme Mix | 1 μL |
Nuclease Free Water | Add to 20 μL |
輕輕混勻并離心;
(2) 逆轉(zhuǎn)錄程序設(shè)置:
25℃ | 5 min |
55℃ | 5-15 min |
85℃ | 5 s |
送樣運(yùn)輸要求:
基因名稱和種屬、或基因ID號(hào)、或成熟的RNA序列;成熟的miRNA有3p和5p之分,故需要告知設(shè)計(jì)3p還是5p,可以參考相關(guān)文獻(xiàn)。
僅供科研用途,不可用于臨床診斷!