實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質測每次聚合酶鏈式反應(PCR)循環(huán)后產物總量的方法。通過內參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。
第一步:提取核酸樣品
首先,從待檢樣品中提取核酸。提取方法根據樣品的性質可以選擇不同的試劑盒,如常用的基于硅膠膜或磁珠法的核酸提取試劑盒。提取的核酸應具有一定的純度和濃度,以保證后續(xù)PCR反應的準確性和穩(wěn)定性。
第二步:設計引物與探針
PCR引物和探針的設計至關重要,它們直接影響PCR的特異性和靈敏度。引物應具有特異性,避免引物間或引物與非靶序列的雜交,探針則應設計在引物的中間位置,用于檢測PCR產物并發(fā)出熒光信號。在設計引物和探針時,建議使用專業(yè)的PCR引物設計軟件,以確保其特異性和穩(wěn)定性。
第三步:制備PCR反應體系
根據實驗需要,合理配置PCR反應體系。通常包括DNA模板、引物、探針、DNA聚合酶、緩沖液、dNTPs等。在配置反應體系時,應盡量避免氣泡產生和樣品交叉污染,保證反應體系的穩(wěn)定性和準確性。
第四步:進行實時熒光定量PCR
將制備好的PCR反應體系加載至實時熒光定量PCR儀器中,設置好反應程序,進行PCR擴增。實時熒光定量PCR儀器可以實時監(jiān)測PCR產物的累積情況,并生成熒光信號曲線。根據曲線的特征可以確定靶基因的表達量或拷貝數。
第五步:數據分析與結果解讀
最后,根據實時熒光定量PCR儀器輸出的數據,進行數據分析和結果解讀。常用的分析方法包括計算Ct值、繪制標準曲線、計算樣品中靶基因的相對表達量等。通過合理的數據分析,可以準確評估實驗結果并得出科學結論。